生产型企业出口业务申请退税的处理流程包括以下几个步骤1：
资格认定：企业首先需要完成工商登记和税务登记，取得合法的经营资格和纳税人身份。企业向主管税务机关申请出口退税资格认定，提交《出口退（免）税资格认定申请表》及相关资料，如营业执照、税务登记证、海关报关单位注册登记证书等。税务机关审核通过后，企业取得出口退税资格。
出口报关与单证收集：企业在货物出口时，需按照海关规定办理出口报关手续，取得出口货物报关单（出口退税专用）。报关单上的信息应准确无误，包括货物名称、数量、金额等。除报关单外，企业还需收集其他相关单证，如出口发票、购货发票、结汇水单（收汇核销单，若有外汇管制）、运输单据（提单等）等。这些单证是申请退税的重要依据。
退税申报：企业使用出口退税申报系统，将出口报关单、购货发票等相关信息录入系统。系统会自动生成出口退税申报数据，包括《生产企业出口货物免、抵、退税申报明细表》和《生产企业出口货物免、抵、退税申报汇总表》等。数据报送与审核企业将生成的申报数据通过电子税务局或前往税务机关办税服务厅报送。税务机关对申报数据进行审核，包括对单证的审核和对数据逻辑关系的审核。审核过程中可能会要求企业补充或更正相关资料。
退税计算与审批：退税计算生产型企业出口退税采用免、抵、退方法计算。免是指免征本企业生产销售环节的增值税；抵是指出口货物所耗用的原材料、零部件等所含应予退还的进项税额，抵顶内销货物的应纳税额；退是指当应抵顶的税额大于应纳税额时，对未抵顶完的税额部分予以退税。审批与退库税务机关根据审核结果和退税计算结果，对企业的退税申请进行审批。审批通过后，税务机关将退税金额从国库退至企业的银行账户。
后续管理：单证备案企业应将出口货物的相关单证进行备案，以备税务机关检查。备案单证包括购货合同、运输单据、报关单等。税务检查与自查企业需配合税务机关的不定期检查，同时也可以定期进行自查，确保出口退税业务的合规性。
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