会计档案的重要程度不同，其保管期限也有所不同。
会计档案的保管期限，根据其特点，分为永久、定期两类。永久档案即长期保管，不可以销毁的档案；定期档案根据保管期限分为3年、5年、10年、15年、25年5种。会计档案的保管期限，从会计年度终了后的第一天算起。
《会计档案管理办法》规定了中国企业和其他组织、预算单位等会计档案的保管期限，该办法规定的会计档案保管期限为最低保管期限，具体规定如下：
需要永久保存的会计档案有：
年度决算财务会计报告； 资本金、股金及股权明细； 开销户登记簿； 客户挂失申请书、挂失登记簿、补发凭单（卡）收据； 账销案存的清单或资料。 会计档案保管登记簿、销毁清册； 7有价单证、业务公章销毁清册； 机构变动交接清册； 有权机关查询、冻结及扣划书； 己用凭证、账簿登记簿； 会计系统数据移植日的所有会计档案； 会计初始环境文本、 基础数据维护修改有关记录、 文件； 其他需要永久保管的档案。
2.保管期限为25年的会计档案有：
现金和银行存款日记账；税收日记账（总账）和税收票证分类出纳账。
3.保管期限为15年的会计档案有：
会计凭证类；总账、明细账、日记账和辅助账簿（不包括现金和银行存款）；会计移交清册；行政单位和事业单位的各种会计凭证；各种完税凭证和缴退库凭证；财政总预算拨款凭证及其他会计凭证；农牧业税结算凭证；会计移交清册。
4.保管期限为10年的会计档案有：
国家金库编送的各种报表及缴库退库凭证；各收入机关编送的报表；财政总预算保管行政单位和事业单位决算、税收年报、国家金库年报、基本建设拨货款年报；税收会计报表（包括票证报表）。
5.保管期限为5年的会计档案有：
下级行上报的中期财务会计报告（月度、季度、半年度 报表及附件、说明）；联行往来清单及查询查复书； 密押代号表使用保管登记簿； 存、贷款单位余额对账回单； 固定资产卡片、固定资产报废清理后卡片；客户申请办理电子支付业务的基本资料、协议； 其他需要保管五年的会计档案。
6.保管期限为3年的会计档案有：
各级行本身及汇总全辖的日计表；会计系统运行日志； 不定期报表；会计检查工作底稿、检查报告、整改情况等检查资料；流水账； 其他需要保管三年的会计档案。
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