根据您的描述，您提到的情况是老板希望将旧公司的生产线转移到新公司，并由新公司负责加工产品，再由旧公司进行销售。这种情况下，是否需要注册一个分公司取决于具体的业务模式和法律要求。以下是一些可能的考虑因素：
1. 业务模式
独立法人：如果新公司和旧公司都是独立的法人实体，那么它们之间的交易需要按照市场规则进行，包括签订合同、开具发票等。这种情况下，不需要注册分公司。
分公司：如果新公司实际上是旧公司的一个分支机构，那么可以考虑注册为分公司。分公司不是独立法人，其法律责任由总公司承担。
2. 法律要求
税务：新公司和旧公司之间的交易需要符合税务规定，包括增值税、所得税等。如果注册为分公司，税务处理可能会有所不同。
工商登记：注册分公司需要向工商行政管理部门申请登记，并提交相关材料。
3. 实际操作
资产转移：将旧公司的生产线转移到新公司，需要进行资产评估，并按照市场价值进行交易。如果注册为分公司，资产转移可能会更加简便。
合同签订：新公司和旧公司之间的加工合同和销售合同需要明确双方的权利和义务，包括价格、质量、交货期等。
结论
根据上述分析，如果新公司和旧公司是独立的法人实体，那么不需要注册分公司，但需要按照市场规则进行交易。如果新公司实际上是旧公司的一个分支机构，那么可以考虑注册为分公司。具体操作需要符合相关法律法规，并进行资产评估和合同签订。
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