根据征收方式的不同，办理途径有所不同：
（1）实行定期定额征收方式征收个人所得税的，仍按各地税务局此前规定的方式和渠道办理申报纳税。
（2）实行查账征收、非定期定额核定征收个人所得税的，具体的办理途径有三种：一是通过各地电子税务局自然人办税服务平台（WEB端）办理纳税申报，可采用银联卡在线支付或个人三方协议等方式缴纳税款。纳税人办理纳税申报时，可先注册个人所得税APP，再通过扫描二维码或者用户名登录自然人办税服务平台（WEB端）办理申报缴税。二是通过办税服务厅办理纳税申报，可采用个人三方协议或POS机刷卡等方式缴纳税款。三是个人独资企业投资者、合伙企业个人合伙人可由被投资单位通过扣缴客户端代为办理申报，并通过个人三方协议或银行端查询等方式缴税。
个人所得税生产经营所得网上申报目前可以通过在自然人税收管理系统扣缴客户端进行代理申报，也可以投资人或业主自己在自然人办税服务平台网页（WEB）上自行申报。 【自然人税收管理系统扣缴客户端】代理申报：办税人员登录扣缴客户端后，点击顶部“生产经营”按钮进入申报模块进行经营所得月（季）度申报、缴款等操作。 【自然人办税服务平台网页（WEB）】业主或投资人可以通过各省的电子税务局网站，跳转到个人所得税网站（WEB）进行申报。首次登录需要通过实名认证，登录成功后，点击顶部“申报管理”按钮进入申报界面，可进行“经营所得个人所得税月（季）度申报（A表）”、“经营所得个人所得税年度申报（B表）”、多处经营所得个人所得税汇总年度申报（C表）。
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